При вводе стоимости обучения на 1-м курсе некоторые специальности высвечиваются красным цветом с пометкой «отсутствуют», хотя эти специальности остались с отчета прошлого года. Откуда появляются такие данные? и как устранить эту проблему?

Это означает, что отсутствует обоснование занижения стоимости. В данных строках Вы ввели стоимость ниже БНЗ и не указали обоснование.