По форме «оценка финансовой устойчивости учреждения…» нужно прикреплять скан документа? Вроде такой функции нет и в таблицах подписи руководителя нет?

Нет, скан прикреплять не нужно. Нужно заполнить формы в электронном виде и завершить заполнение форм (пункт меню «Заполнение форм» – «Передать документы в министерство»).