Министерство науки и
высшего образования
Российской Федерации
Портал
информационного взаимодействияс организациями и учреждениями, участниками бюджетного процесса Минобрнауки России

Если нет направления на первом курсе, а 2-ой и последующие есть, то оставлять его во вкладке направления подготовки?

Да, оставляйте.