Для формирования плана ФХД на 2018 год и плановые 2019, 2020 г. планы доходов и планы функциональных расходов надо новые создавать или вносить изменения в вошедшие в план ФХД на 2017 и плановые 2018, 2019, представленные в Минобрнауки РФ?

В ПФХД входят все утвержденные планы доходов и планы функциональных расходов на один и тот же финансовый период. Таким образом, если Вы создадите новые ПД и ПФР и утвердите их, то в ПФХД у Вас войдут оба плана и цифры задвоятся, поэтому целесообразней вносить изменения в планы, которые уже были созданы.